Levantamento realizado pelo portal Jornalistas&Cia apontou Zero Hora como o terceiro veículo mais premiado do Brasil no ano de 2013. A conquista do Esso de Jornalismo, principal premiação da imprensa do país, pela reportagem Os arquivos secretos do coronel DOI-CODI, foi uma das principais responsáveis pela colocação do jornal. Essa foi a primeira vez na história do prêmio que um veículo do Rio Grande do Sul recebeu o reconhecimento.

A matéria conquistou ainda outros prêmios, como o Hours Concours do Prêmio Direitos Humanos de Jornalismo e o ARI de Reportagem Impressa. Outra reportagem representativa para a terceira posição de Zero Hora foi A agonia das estradas, que conquistou o Setcergs, o CBIC e o Grande Prêmio CNI de Jornalismo. Em 2013, o jornal também recebeu reconhecimentos como Embratel, Vladimir Herzog e Libero Badaró. O periódico gaúcho obteve um total de 570 pontos. Em 11º lugar encontra-se a Rádio Gaúcha, com 215 pontos. O primeiro colocado do ranking, a Folha de São Paulo, fechou o ano com 835 pontos, enquanto o segundo colocado, a Rede Globo, ficou com 680 pontos. No ranking dos veículos mais premiados de todos os tempos, também elaborado pelo Jornalistas&Cia e que soma os pontos dos principais prêmios ao longo dos anos, Zero Hora aparece em quarto lugar, a Rádio Gaúcha em nono, e a RBS TV em 11º. Confira os rankings completos dos veículos mais premiados de todos os tempos e dos mais premiados em 2013.